Murat Can Çobanoğlu 2004 yılında TED Ankara Koleji International Baccalaureate programından mezun oldu. 2004-2008 yılları arasında Sabancı Üniversitesi Bilgisayar Bilimleri ve Mühendisliği (anadal) ve Matematik (yandal) eğitimini yüksek başarı ödülü, onur bursu, ve dereceyle tamamladı. Daha sonra, gene Sabancı Üniversitesi’nde, 2008-2010 yılları arasında Bilgisayar Bilimleri ve Mühendisliği yüksek lisans programını Tübitak BİDEB bursuyla tamamladı. Doktorasını Amerika’da burslu olarak Carnegie Mellon Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Fakültesi ve Pittsburgh Üniversitesi Tıp Fakültesi ortak işlemsel biyoloji programında olağanüstü akademik başarı ödülü ile tamamladı. Bu dönemdeki çalışmalarında ilaç-protein etkileşimlerinin yapay zeka ile tahmini, ve bu yöntemlerin biyomedikal problemlere uygulamaları üzerine çalıştı. Bu süreçte alpha-1 antitripsin yetmezliği ve Huntington hastalığında etkili olabilecek ilaç adayları buldu. Daha sonra Teksas Üniversitesi Southwestern Tıp Merkezi Lyda Hill Biyoinformatik Departmanına, ilk UT Southwestern Distinguished Fellow olarak katıldı. İş dışındaki zamanlarında eskrim yapmaktadır ve Dallas Sanat Müzesi üyesidir.